Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SNX13Q9Y5W8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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SNX13Q9Y5W8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX13Q9Y5W8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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