Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCDHB4Q9Y5E5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms