Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HDGFL3Q9Y3E1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms