Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMED7Q9Y3B3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMED7Q9Y3B3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms