Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF3IP3Q9Y228 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAF3IP3Q9Y228 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms