Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIAA1024Q9UPX6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIAA1024Q9UPX6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIAA1024Q9UPX6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIAA1024Q9UPX6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIAA1024Q9UPX6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KIAA1024Q9UPX6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIAA1024Q9UPX6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIAA1024Q9UPX6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIAA1024Q9UPX6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIAA1024Q9UPX6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIAA1024Q9UPX6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIAA1024Q9UPX6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIAA1024Q9UPX6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KIAA1024Q9UPX6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIAA1024Q9UPX6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIAA1024Q9UPX6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms