Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AGAP1Q9UPQ3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AGAP1Q9UPQ3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms