Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4E1Q9UPM8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4E1Q9UPM8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms