Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYNPO2Q9UMS6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms