Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPDR1Q9UM22 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms