Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNRF3Q9ULT6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNRF3Q9ULT6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms