Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BRPF3Q9ULD4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BRPF3Q9ULD4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms