Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDH9Q9ULB4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH9Q9ULB4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms