Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMPRSS11EQ9UL52 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMPRSS11EQ9UL52 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms