Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNMA3Q9UL41 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNMA3Q9UL41 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms