Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP21Q9UK80 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP21Q9UK80 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
USP21Q9UK80 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms