Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX4Q9UIU6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX4Q9UIU6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms