Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLCO3A1Q9UIG8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms