Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNA3Q9UI47 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA3Q9UI47 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms