Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX25Q9UHL0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms