Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF20Q9UGU0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCF20Q9UGU0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms