Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRP2BPQ9P2M1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRP2BPQ9P2M1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRP2BPQ9P2M1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRP2BPQ9P2M1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRP2BPQ9P2M1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRP2BPQ9P2M1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRP2BPQ9P2M1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRP2BPQ9P2M1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms