Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL9Q9P2J3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL9Q9P2J3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms