Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
RRBP1Q9P2E9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RRBP1Q9P2E9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms