Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PCDH10Q9P2E7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCDH10Q9P2E7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms