Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC44.01■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC44.01■■■■■ 4.64
CCDC180Q9P1Z9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC43.99■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC43.99■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC43.98■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC43.98■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC43.98■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC43.97■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC43.97■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC43.96■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC43.96■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC43.95■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC43.95■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC43.95■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.94■■■■■ 4.63
CCDC180Q9P1Z9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC43.94■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC43.93■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC43.92■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC43.92■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC43.92■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.91■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC43.91■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC43.9■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
CCDC180Q9P1Z9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.89■■■■■ 4.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms