Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HACD3Q9P035 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACD3Q9P035 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms