Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COA4Q9NYJ1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
COA4Q9NYJ1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms