Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSD3Q9NYI0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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