Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTMR4Q9NYA4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTMR4Q9NYA4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms