Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DNAJC28Q9NX36 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC28Q9NX36 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms