Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLE1Q9NVX2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NLE1Q9NVX2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms