Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLHL11Q9NVR0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL11Q9NVR0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms