Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SALL1Q9NSC2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL1Q9NSC2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms