Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT82Q9NSB4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT82Q9NSB4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms