Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KCNIP2Q9NS61 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KCNIP2Q9NS61 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms