Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HELLSQ9NRZ9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HELLSQ9NRZ9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms