Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHST12Q9NRB3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHST12Q9NRB3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms