Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEC31BQ9NQW1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms