Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
INCENPQ9NQS7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
INCENPQ9NQS7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms