Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RAB18Q9NP72 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB18Q9NP72 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms