Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX8Q9HC52 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms