Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3GQ9HC16 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC3GQ9HC16 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms