Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LY9Q9HBG7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LY9Q9HBG7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms