Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUDS3Q9H7L9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUDS3Q9H7L9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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