Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF41Q9H4P4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF41Q9H4P4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms