Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NXF3Q9H4D5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NXF3Q9H4D5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NXF3Q9H4D5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms