Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDCL3Q9H2J4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCL3Q9H2J4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms