Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SIL1Q9H173 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIL1Q9H173 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms