Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB17Q9H0T7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB17Q9H0T7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB17Q9H0T7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB17Q9H0T7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB17Q9H0T7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB17Q9H0T7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB17Q9H0T7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB17Q9H0T7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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